Definidos os oito clube classificados na primeira fase, a Série C do Campeonato Brasileiro terá sua primeira rodada dos jogos das quartas de final no dia 1º de outubro. A segunda rodada que apontará os quatro semifinalistas, acontecerá dia 9 de outubro. Pelo grupo A, se classificaram para as quartas Fortaleza, ABC, Botafogo-PB e ASA.
Pelo Grupo B, vão para as quartas de final Guarani, Boa Esporte-MG, Botafogo-SP e Juventude-RS.
Confira os confrontos das fases: