Para aqueles que querem embarcar da capital para a Ilha de Itaparica, o atendido é feito normalmente, com as embarcações saindo do Terminal Náutico, no Comércio, e atracando no Terminal do Sistema Ferryboat, em Bom Despacho.
O sistema Salvador-Mar Grande está com oito embarcações em tráfego e cinco na reserva, e tem movimento moderado de passageiros. Os horários de saída são de 30 em 30 minutos. As condições de navegação na Baía de Todos os Santos são excelentes, com mar calmo e ventos fracos. O último horário saindo de Salvador será às 20h e de Mar Grande, às 18h30.
As operações da linha marítima Salvador-Morro de São Paulo ocorrem sem qualqyuuer restrição, hoje. 9h, 10h30, 13h30 e 14h. Já as saídas de Morro de São Paulo são às 9h, 9h30, 12h30 e 15h. .A passagem custa R$ 75 e o tempo de viagem é de 2h20. Também operam normalmente as escunas que fazem o tour turístico pelas ilhas da Baía de Todos-os-Santos.
